根據自然人口增長預測及已規劃的房屋發展，我們推算於2039年後南大嶼山的人口將達至約12600人，並產生每日約5800立方米的污水量。為應付排污需求，我們於貝澳建造污水幹渠系統，於䃟石灣建造一座二級污水處理廠，以及於羅屋村建造鄉村污水收集系統。

​工程完成後，已鋪設排污渠地區內的污水將會輸往擬議的污水處理廠作妥善處理，而淨化水則會經海底排放管道排放至南大嶼山離岸約1.4公里的海域。